Napajedelský hřebčín, který přiléhá k zámeckému parku na jižní straně, založil v roce 1886 Aristides Baltazzi manžel hraběnky ze Stockau, hřebčín pro chov anglického plnokrevníka. Komplex původních stájí hřebčína se zachoval dodnes. A. Baltazzi začal později budovat četné stáje, výběhy a pastviny pro plemenné koně také v Otrokovicích. Všechny louky v okolí vystavěných objektů sloužily výhradně pastvě. Ostatní dvory, lesy a podniky velkostatku dodávaly hřebčínu své produkty. Velmi nákladné bylo kupování klisen i hřebců, většinou z Anglie. Anglický hřebec Matchbox stál např. 200 000 zlatých. Na počátku 20. století však již měl velkostatek dluh asi 7 milionů tehdejších rakouských korun.

Hřebčín ale přežil až do dnešních dnů a výběh uprostřed hřebčína připomíná, že se zde konají dražby ročků, na které se sjíždějí chovatelé z celého světa. Hřebčín je v současnosti nejvýznamnějším producentem dostihových koní v České republice, ročně se zde narodí kolem 60 hříbat.

V letním období pořádá správa hřebčína exkurze pro organizované skupiny.